Simples... Porque os atomos sao organizaçoes diferentes e em diferentes quantidades das mesmas particulas sub-atomicas...
Ou seja, de forma simples: Um atomo é tao diferente do outro quanto uma especie é da outra... Um Atomo de Hidrogenio só possui um Proton enquanto um de Hélio possui 2... isso os torna diferentes...
Mas talvez sua pergunta esteja relacionada ao atomos iguas como o de carbono...
Quase tudo o que conhecemos (e usamos no dia a dia) é feito de Carbono, Vc, seu cachorro, a madeira e etc... Ainda assim, Vc é diferente de seu cachorro e da madeira, pois a organizaçao de seus atomos de carbono é diferente da deles...
pra ser bem simples - é como se fosse um bloco de lego... sempre arrumados em diferentes formatos.... !!!
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